Diagnostyka częścią projektu monitorowania zmienności genetycznej wirusa Sars-CoV-2
Laboratoria Diagnostyki, we współpracy z GIS, brały czynny udział w projekcie projektu monitorowania zmienności genetycznej wirusa Sars-CoV-2 i odpowiedzialne były za gromadzenie i analizę próbek spełniających określone kryteria.
W zakresie usług sekwencjonowania, projekt wspierało między innymi stowarzyszone w Grupie Diagnostyka laboratorium genXone S.A.
Projekt realizował zespół naukowców z Małopolskiego Centrum Biotechnologii UJ, koordynowany przez profesora Krzysztofa Pyrcia. Uzyskane informacje posłużyły do lepszego zrozumienia wydarzeń w kraju, ale również do rozszerzenia analiz prowadzonych na całym świecie i uwzględnienia w nich Polski.
Wszystkie dane były przekazywane bezpośrednio do stron: Agencji Badań Medycznych, Ministerstwa Zdrowia oraz udostępniane dla wszystkich zainteresowanych poprzez bazę danych GisAid oraz wizualizacje na stronie sarswpolsce.pl.
W krakowskim ośrodku, jako jednym z pierwszych, prace nad sekwencjonowaniem i monitorowaniem zmienności wirusa podjęto już na początku 2020 roku. Dotyczyły one analizy zmienności genetycznej wirusa oraz analiz pozwalających na ocenę powiązań pomiędzy genotypem i fenotypem.
W ramach projektu zebrano w sumie 9558 próbek zawierających wirusa SarsS-CoV-2, które po wstępnej ocenie posłużyły do uzyskania 8337 sekwencji wirusa. Dzięki sprawnej organizacji oraz optymalizacji kosztów udało się zrealizować założone cele, a liczba przeanalizowanych próbek przekroczyła zakładaną.
Diament Forbesa dla spółki Diagnostyka
W okresie monitoringu zaobserwowano obecność 132 odrębnych wariantów wirusa Sars-CoV-2, spośród których 97,5 procent stanowiły warianty niebezpieczne. Największy odsetek, czyli 38,3 procent wszystkich próbek stanowił wariant Delta. Było to bezpośrednio związane z okresem realizacji projektu, który obejmował głównie jesienną falę zakażeń. Dwa pozostałe najczęściej wykrywane warianty Alfa oraz Omikron stanowiły kolejno 37,7 procent oraz 21,2 procent.
Projekt był realizowany od 1 lutego 2021 roku do 30 kwietnia 2022, dzięki dofinansowaniu Agencji Badań Medycznych.
Diagnostyka to największa w Polsce sieć laboratoriów medycznych, specjalizująca się w realizacji profesjonalnych usług – od pobrania i transportu materiału biologicznego, poprzez wykonanie badania, aż do dostarczenia wyniku analiz medycznych w możliwie najkrótszym czasie. Posiada ponad 1000 punktów pobrań w całej Polsce, wykonując rocznie 120 milionów badań dla ponad 18 milionów pacjentów.